Mikrosatelliteninstabilität: Observation


Inhalt

Dieses Profil beschreibt die Mikrosatelliteninstabilität (MSI). Es erlaubt den Rohdatenmesswert als Quantity anzugeben, sowie die klinisch relevantere Interpretation.

Es existieren zwei verschiedene Interpretationsskalen : Einerseits MSI-H | MSI-L | Stable, andererseits Stable | Unstable | Indeterminate. Das vorliegende Profil lässt beide Arten der Interpretation zu.


Verknüpfungen zu anderen Ressourcen


NameStatusVersionCanonicalBasis
MII_PR_MTB_Mikrosatelliteninstabilitaetdraft2024.0.0-ballothttps://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-mtb/StructureDefinition/mii-pr-mtb-mikrosatelliteninstabilitaethttps://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-mtb/StructureDefinition/mii-pr-mtb-molekularer-biomarker

Inhalt

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Beschreibt die Neigung zu Mutationen aufgrund einer gestörten Fehlpaarungsreparatur (DNA mismatch repair, MMR).

FeldnameKurzbeschreibung
Observation.status
Observation.category
Observation.subject
Observation.encounter
Observation.value[x]
Observation.interpretation
Observation.methodIHC|PCR|bioinformatic
Observation.specimen
<StructureDefinition xmlns="http://hl7.org/fhir">
<id value="mii-pr-mtb-mikrosatelliteninstabilitaet" />
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<title value="MII PR MTB Mikrosatelliteninstabilität" />
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<element id="Observation.method">
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<element id="Observation.specimen">
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"resourceType": "StructureDefinition",
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},
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]
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"id": "Observation.encounter",
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"id": "Observation.interpretation",
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}
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"id": "Observation.method",
"path": "Observation.method",
"short": "IHC|PCR|bioinformatic",
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}
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"id": "Observation.specimen",
"path": "Observation.specimen",
"mustSupport": true
}
]
}
}

Mapping Datensatz zu FHIR


Suchparameter

Folgende Suchparameter sind für das Modul Onkologie relevant, auch in Kombination:

  1. Der Suchparameter "_id" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?_id=1234

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "_id" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Parameters for all resources".

  2. Der Suchparameter "_profile" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?_profile=https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-mtb/StructureDefinition/mii-pr-mtb-mikrosatelliteninstabilitaet

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "_profile" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Parameters for all resources".

  3. Der Suchparameter "status" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?status=final

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "status" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  4. Der Suchparameter "category" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?category=http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category|laboratory

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "category" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  5. Der Suchparameter "code" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?code=http://loinc.org|69548-6

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "code" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  6. Der Suchparameter "subject" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?subject=Patient/example-mii-mtb-patient

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "subject" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  7. Der Suchparameter "focus" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?focus=Condition/example-mii-mtb-diagnose

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "focus" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  8. Der Suchparameter "encounter" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?encounter=Encounter/12345

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "encounter" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  9. Der Suchparameter "interpretation" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?interpretation=http://loinc.org|LA14122-8

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "interpretation" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  10. Der Suchparameter "method" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?method=http://loinc.org|LA26398-0

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "method" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  11. Der Suchparameter "specimen" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?specimen=Encounter/12345

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "specimen" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".


Beispiele

Observation.id[0]MII-EXA-MTB-Mikrosatelliteninstabilitaet-1
Observation.meta[0].profile[0]https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-mtb/StructureDefinition/mii-pr-mtb-mikrosatelliteninstabilitaet
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Observation.method[0].coding[0].system[0]https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-mtb/CodeSystem/mii-cs-mtb-msi-method-type
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Observation.method[0].coding[0].display[0]Sequenzierung
Observation.specimen[0].reference[0]Specimen/example
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"resourceType": "Observation",
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}
]
}
],
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{
"code": "LA14122-8",
"system": "http://loinc.org",
"display": "Stable"
}
]
}
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"status": "final",
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"code": "81695-9",
"system": "http://loinc.org",
"display": "Microsatellite instability [Interpretation] in Cancer specimen Qualitative"
}
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"subject": {
"reference": "Patient/example"
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"reference": "Encounter/example"
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"value": 2.61,
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"system": "http://unitsofmeasure.org"
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"code": "bioinformatic",
"system": "https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-mtb/CodeSystem/mii-cs-mtb-msi-method-type",
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}
]
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}
}