Specimen


Inhalt

Dieses Profil beschreibt Gewebeproben (Specimens) beim Kolorektalen Karzinom, die im Rahmen operativer Eingriffe entnommen werden. Es umfasst sowohl die Charakterisierung des Gewebes als auch spezifische pathologische Aspekte wie die TME-Qualität (Totale mesorektale Exzision) bei Rektumkarzinomen.

Das Profil basiert auf einer FHIR Specimen-Ressource und stellt die Verbindung zwischen der chirurgischen Entnahme und der pathologischen Aufarbeitung her.


Verknüpfungen zu anderen Ressourcen

Das KRK-Specimen ist ein wichtiges Bindeglied in der Diagnostikkette:

  • verweist über Specimen.subject auf den Patienten (Patient-Ressource)
  • steht in Bezug zur Entnahme-Procedure über Specimen.collection.procedure
  • kann mit pathologischen Observations verknüpft werden (z.B. Histologie, Grading)
  • dient als Basis für die Bestimmung von Resektionsrändern und TNM-Klassifikation

oBDS-Kontext

Das KRK-Specimen bildet die Grundlage für verschiedene oBDS-Bewertungen:

  • Pathologische Beurteilung des Resektats
  • TME-Qualität bei Rektumkarzinomen (KR4)
  • Histopathologische Charakteristika des Tumors
  • Resektionsrandbeurteilung

Terminologie-Binding

Das Profil verwendet spezialisierte ValueSets für kolorektale Specimens, insbesondere für die Bewertung der TME-Qualität und anderer pathologischer Parameter.

ValueSet: MII VS Onko KRK TME Qualität

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Inhalt

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Histologie: Dieses Profil beschreibt eine Gewebeprobe in der Onkologie.

Feldname
Specimen.condition
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}
}
]
}
}

Mapping Datensatz zu FHIR

DatensatzErklaerungFHIR
TME Qualität

Qualität der totalen mesorektalen Exzision (Grad 1-3).

Specimen.where(meta.profile.contains('https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-onko/StructureDefinition/mii-pr-onko-krk-specimen')).extension

Mapping Einheitlicher onkologischer Basisdatensatz (oBDS) zu FHIR

oBDSDefinitionFHIR
6HistologieSpecimen
6.2Histologie-EinsendenummerSpecimen.accessionIdentifier.value
6.1Tumor HistologiedatumSpecimen.collection.collected[x]

Suchparameter

Folgende Suchparameter sind für das KRK-Specimen Profil relevant, auch in Kombination:

  1. Der Suchparameter "_id" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Specimen?_id=12345

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "_id" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Parameters for all resources".

  2. Der Suchparameter "_profile" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Specimen?_profile=https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-onko/StructureDefinition/mii-pr-onko-krk-specimen

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "_profile" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Parameters for all resources".

  3. Der Suchparameter "subject" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Specimen?subject=Patient/test

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "Specimen.subject" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  4. Der Suchparameter "type" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Specimen?type=http://snomed.info/sct|119376003

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "Specimen.type" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Token Search".

  5. Der Suchparameter "status" MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Specimen?status=available

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "Specimen.status" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Token Search".


Beispiele

{
"resourceType": "Specimen",
"id": "mii-exa-onko-krk-specimen",
"meta": {
"profile": [
"https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-onko/StructureDefinition/mii-pr-onko-krk-specimen"
]
},
"status": "available",
"type": {
"coding": [
{
"code": "122652004",
"system": "http://snomed.info/sct",
"display": "Specimen from colon obtained by rectal/rectosigmoid (low anterior) resection (specimen)"
}
]
},
"subject": {
"reference": "Patient/example"
},
"collectedDateTime": "2024-03-22T08:30:00+01:00"
},
"value": "KRK-2024-001234"
},
{
"coding": [
{
"code": "1",
"system": "https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-onko/CodeSystem/mii-cs-onko-krk-tme-qualitaet",
"display": "Grad 1 (gut)"
}
]
}
],
"note": [
{
"text": "Sigmaresekat mit Primärtumor und regionären Lymphknoten"
}
]
}