MII-Initiative

Medizininformatik Initiative - Modul Pathologie-Befund - ImplementationGuide

MII PR Patho Finding

Beschreibung

Das Profil MII PR Patho Finding der Ressource Observation bildet als hasMember- oder derivedFrom-Referenz für ein Profil vom Typ MII PR Patho Section Grouper atomare kodierte Untersuchungsergebnisse ab. Dieses Profil kann verschachtelte Konstrukte bilden, um „Child Observations“ zu erfassen, die eine einzelne Observation weiter spezifizieren. PathoFindings können vom Pathologie-Informationssystem über Questionnaire- / QuestionnaireResponse-Resourcen (siehe HL7-Implementation Guide Structured Data Capture) bereitgestellt werden, bzw. werden QuestionnaireResponse Ressourcen referenziert. Jedes MII PR Patho Finding sollte die Probe referenzieren, an der die Beobachtung vorgenommen wurde.

Sonderfall:

  • Im Falle eines Befundupdates dient ein MII PR Patho Finding] mit dem LOINC-Code 90004-3 - Clinical significance of updated information als Organizer für die Update-Informationen, die im MII PR Patho Diagnostic Conclusion Grouper abgebildet werden. Hierzu wird die focus-Referenz genutzt, um auf den betroffenen MII PR Patho Grouper (Beobachtungsabschnitt) hinzuweisen. Der Observation.value wird durch einen ValueSet "ClinicalSignificance" (z.B. LOINC LL4770-5) dargestellt.

Für spezifische Observation-Konstrukte, speziell bei onkologischen Fragestellungen (TNM, Histologischer Tumortyp, etc.), kann auch auf Observation-Profile des MII Erweiterungsmoduls Onkologie (sofern vorhanden) oder HL7 DE Basis Onkologie zurückgegriffen werden.

NameCanonical
MII_PR_Patho_Findinghttps://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-patho/StructureDefinition/mii-pr-patho-finding

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{
    "resourceType": "StructureDefinition",
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    "description": "Instantiable Observation to describe a generic pathology finding",
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    "kind": "resource",
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                "type":  [
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                        "code": "Quantity"
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                        "code": "Ratio"
                    }
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            }
        ]
    }
}

Liste aller Must-Support Datenelemente

FHIR-Element Erklärung
Observation.id Must-support, jedoch optional
Observation.text Nicht empfohlenes, optionales Narrativ der Observation, nicht identisch mit dem Observation.code.display oder einem Observation.valueString (siehe Composition.text und Composition.section.text)
Observation.meta.lastUpdated Must-support, jedoch optional
Observation.meta.profile Must-support, jedoch optional
Observation.identifier Observation muss eindeutig identifizierbar sein, keine Vorgaben zur Kodierung, Präferenz: Ableitung aus der Eingangsnummer (Part-Block-Slide)
Observation.basedOn Auftrag, der die Beobachtung veranlasst hat
Observation.status Finale & vorläufige Ergebnisse sind zulässig
Observation.category HL7 Code "laboratory", weitere Codings bei generischen Einzelbeobachtungen vorgesehen: LOINC-codes der Sections, zu der die Einzelbeobachtung gehört
Observation.code LOINC Codes, bei fehlenden Codes SNOMED CT gemäß https://confluence.ihtsdotools.org/display/DOCLOINC/5.2+Practical+Guidance+on+Uses+of+SNOMED+CT+and+LOINC
Observation.subject Patient (erbt von Modul Person der MII https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/core/modul-person/StructureDefinition/Patient)
Observation.effective Klinisch relevanter Zeitpunkt /-periode für die Beobachtung, meist Zeit der Probenentnahme
Observation.value[x] Kodierte oder nicht kodierbare/ nicht numerische Beobachtungsergebnisse
Observation.bodySite Körperstelle wo die Beobachtung gemacht wurde
Observation.method kodierte Methode, die zur Beobachtung genutzt wurde
Observation.specimen Probe, an der die Beobachtung erfolgte
Observation.hasMember zum Untersuchungs-/Beobachtungspanel zugehörige Beobachtung / QuestionnaireResponse
Observation.derivedFrom Referenz auf eine Messung / ein Bild / eine QuestionnaireResponse / ein Dokument, von dem die Beobachtung abgeleitet wurde

Referenz zum Logical Model

FHIR-Element Logisches Datenmodell
Observation.id Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.id
Observation.text Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Text
Observation.meta Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.meta
Observation.identifier Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Identifikation
Observation.basedOn Untersuchungsauftrag
Observation.status Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Status
Observation.category Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Kategorie
Observation.code Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Code
Observation.subject Patient
Observation.effective Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Befundzeit
Observation.issued Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Datum
Observation.performer Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Durchführender (.Autor, .Informant)
Observation.value Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Wert
Observation.dataAbsentReason
Observation.interpretation Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Interpretation
Observation.note Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Kommentar
Observation.method Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Methode
Observation.specimen Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Probe
Observation.hasMember Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Unterbeobachtung
Observation.derivedFrom Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.EingebettetesBild
Observation.component Generische Pathologisch-anatomische Einzelbeobachtung.Unterbeobachtung

Suchparameter

Folgende Suchparameter sind für das Modul Pathologie-Befund relevant, auch in Kombination:

  1. Der Suchparameter _id MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?_id=103270

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach _id finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Parameters for all resources".

  2. Der Suchparameter _lastUpdated MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?_lastUpdated=2021-12-08

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach _lastUpdated finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Parameters for all resources".

  3. Der Suchparameter _profile MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?_profile=https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-patho/StructureDefinition/mii-pr-patho-report

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach _profile finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Parameters for all resources".

  4. Der Suchparameter based-on MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?based-on=ServiceRequest/124455

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.basedOn finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  5. Der Suchparameter category MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?category=http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category|laboratory

    GET [base]/Observation?category=laboratory

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.category finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  6. Der Suchparameter code MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?code=http://loinc.org|94738-2

    GET [base]/Observation?code=94738-2

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.code finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  7. Der Suchparameter data-absent-reason MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?data-absent-reason=http://hl7.org/fhir/codesystem-data-absent-reason.html|unknown

    GET [base]/Observation?data-absent-reason=unknown

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.data-absent-reason finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  8. Der Suchparameter date MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?date=2021-06-01

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.date finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "date".

  9. Der Suchparameter derived-from MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?derived-from=Media/ex-mii-patho-attached-image

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.derivedFrom finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  10. Der Suchparameter encounter MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?encounter=Encounter/769808

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.encounter finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  11. Der Suchparameter has-member MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?has-member=Observation/ex-mii-patho-biopsy-site-a

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.hasMember finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  12. Der Suchparameter identifier MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?identifier=https://pathologie.klinikum-karlsruhe.de/fhir/fn/befundbericht|12345

    GET [base]/Observation?identifier=12345

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.identifier finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  13. Der Suchparameter patient MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?patient=Patient/12345

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.subject.​where(resolve() is Patient) finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  14. Der Suchparameter performer MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?performer=Practitioner/2346545

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.performer finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  15. Der Suchparameter specimen MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/DiagnosticReport?specimen=Specimen/987976

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.specimen finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  16. Der Suchparameter status MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?status=final

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.status finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  17. Der Suchparameter subject MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?subject=Patient/12345

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.subject finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "reference".

  18. Der Suchparameter value-string MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?value-string:contains=Makroskopie

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.value finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "string".

  19. Der Suchparameter body-site MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?body-site=716917000

    GET [base]/Observation?body-site=http://snomed.info/sct|716917000

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach Observation.bodySite finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  20. Der Suchparameter value-ratio MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?value-ratio=le5.4|http://unitsofmeasure.org|mg

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach (Observation.value as Quantity) | (Observation.value as Ratio) finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "quantity".

  21. Der Suchparameter combo-value-concept MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?body-site=716917000 GET [base]/Observation?combo-value-concept=http://snomed.info/sct|716917000

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach (Observation.value as CodeableConcept) | (Observation.​component.​value as CodeableConcept) finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "token".

  22. Der Suchparameter combo-value-quantity MUSS unterstützt werden:

    Beispiele:

    GET [base]/Observation?combo-value-quantity=le5.4|http://unitsofmeasure.org|mg

    Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach (Observation.value as Quantity) | (Observation.​value as SampledData) | (Observation.​component.​value as Quantity) | (Observation.​component.​value as SampledData) finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "quantity".


Beispiele

{
    "resourceType": "Observation",
    "id": "mii-exa-patho-biopsy-site-a",
    "meta": {
        "profile":  [
            "https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-patho/StructureDefinition/mii-pr-patho-finding"
        ]
    },
    "category":  [
        {
            "coding":  [
                {
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                    "system": "http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category"
                }
            ]
        },
        {
            "coding":  [
                {
                    "code": "22634-0",
                    "system": "http://loinc.org"
                }
            ]
        }
    ],
    "status": "final",
    "code": {
        "coding":  [
            {
                "code": "94738-2",
                "system": "http://loinc.org",
                "display": "Biopsy site Patient"
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        "extension":  [
            {
                "url": "http://hl7.org/fhir/StructureDefinition/narrativeLink",
                "valueUrl": "#macro-a-biopsy-site-key"
            }
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    "valueCodeableConcept": {
        "coding":  [
            {
                "code": "716917000",
                "system": "http://snomed.info/sct",
                "display": "Structure of lateral middle regional part of peripheral zone of right half prostate (body structure)"
            }
        ],
        "extension":  [
            {
                "url": "http://hl7.org/fhir/StructureDefinition/narrativeLink",
                "valueUrl": "#macro-a-biopsy-site-value"
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        ]
    },
    "derivedFrom":  [
        {
            "reference": "Media/mii-exa-patho-attached-image"
        }
    ],
    "specimen": {
        "reference": "Specimen/mii-exa-patho-he-stained-slide-prostate"
    }
}