MII-Initiative

MII IG Modul Biobank v2025

Datensätze inkl. Beschreibungen

Die offizielle Version des Informationsmodells für das Erweiterungsmodul Biobank findet sich auf Art-Decor. Zur Vereinheitlichung der Repräsentation wurde das Informationsmodell zusätzlich als FHIR Logical Model abgebildet:

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Proben-ID0..1Identifier
Probenart0..1CodeableConcept
ProbenmengeI0..1Quantity
Verfuegbarkeitsstatus0..1code
Projektverwendung0..1string
SonstigeEigenschaften0..1string
Ist-gewonnen-ausI0..1Reference()
FestgestellteDiagnoseI0..1Reference()
gehoert-zuI0..1Reference()
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Containertyp0..1CodeableConcept
KapazitaetI0..1Quantity
VerwendungAdditiv0..1boolean
Additiv0..*CodeableConcept
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Entnahme-ID0..1Identifier
EinstellungBlutversorgung0..1dateTime
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Entnahmestelle0..1CodeableConcept
Nuechternstatus0..1CodeableConcept
NuechternstatusDauerI0..1Quantity
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Startzeitpunkt0..1dateTime
Endzeitpunkt0..1dateTime
Verarbeitungstyp0..1BackboneElement
TemperaturI0..1Range
Modus0..1CodeableConcept
VerwendungAdditive0..1boolean
Additiv0..*CodeableConcept
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Einlagerungszeitpunkt0..1dateTime
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LagerungsbedingungenI0..1Range
LaborbefundI0..1Reference()
PathologiebefundI0..1Reference()
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Vorname0..1string
Nachname0..1string
E-Mail0..1string
Rolle0..1CodeableConcept
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Sammlungs-ID0..1Identifier
BBMRI-ERIC-ID0..1Identifier
Akronym0..1string
Name0..1string
Beschreibung0..1string
Sammlungstyp0..1CodeableConcept
besteht-ausI0..*Reference()

Es ist zu beachten, dass das Logical Model rein auf die Abbildung der Datenelemente und deren Beschreibung abzielt. Verwendete Datentypen sind nicht als verpflichtend anzusehen. Dies wird abschließend durch die FHIR-Profile festgelegt. Für jedes Element innerhalb des Logical Models existiert ein Mapping auf ein Element einer konkreten FHIR Ressource.

Weitere Probeneigenschaften

In einigen Fällen kann es nötig sein, weitere Eigenschaften einer Probe wie z.B. Zellzahlen oder DNA/RNA-Konzentration zu erfassen. In der aktuellen Version des Modules werden dazu keine Vorgaben in Form von FHIR-Profilen gemacht, es wird aber eine Modellierung über die FHIR-Ressource Observation empfohlen. Hier kann die Probe im Feld specimen referenziert werden. Als Codes können SNOMED Codes wie 118218001 |Cell count (procedure)| oder LOINC Codes wie 72496-3 DNA double strand [Mass/volume] in Specimen verwendet werden. In folgenden Versionen dieses Modules werden hierzu möglicherweise weitere Festlegungen erfolgen.