MII IG Molekulares Tumorboard DE v2025

parent: topic: Immunhistochemie PDL1 subject: https://www.medizininformatik-initiative.de/fhir/ext/modul-mtb/StructureDefinition/mii-pr-mtb-immunohistochemistry

P-Immunhistochemie: Observation

Inhalt

Dieses Profil beschreibt den IHC-Befund, der ein Protein speziell in seiner phosphorylierten Form nachweist.

Es existieren derzeit keine international anerkannenten Spezifkation zur präzisen und harmonisierten Darstellung von posttranslationalen Modifikationen.

Dieses Profil soll daher ein erstes Konzept zur generalisierten Erschließung von post-translationalen Modifikation am Beispiel Für Details

Es ist zu erwarten, dass in den Datenintegrationszentren anfangs nicht die vollständigen Informationen vorliegen.

Beispiel: Das Gen Rb-1 hat mit Serin eine mögliche Phosphorylierungsstelle an Position 949 (siehe p-RB-Seite auf UniProt, unter dem Abschnitt PRTM/Processing https://www.uniprot.org/uniprotkb/Q13733/entry). Die Proteine AKT1, AKT2 und AKT3 hingegen haben zwei potentielle Phosyphorylierungsstellen, die von verschiedenen Enzymen aktiviert werden: Thr308 und Ser473, wobei vor allem für den Nachweis der letzten Mutation eine negative Prognose existiert.

Die

Im vereinfachten Ausdruck p-Akt wäre also nicht eindeutig bestimmbar, welcher exakte Phosphorylierungsstatus / Isoform vorliegt.

Hier ist nicht ersichtlich, an welcher Stelle eine Phosphorylierung vorliegt, daher ist keine präzise Angabe einer phosphorylierungsstelle möglich.

Es existieren mehrere Ansätze, wie trotzdem eine Abgrenzung zur nicht-phosphorylierten Version vorgenommen werden kann. Für Details sei auf die Diskussion posttranslationaler Modifikation auf der UniProt-Seite verwiesen https://www.uniprot.org/help/mod_res:

• Angabe des Antikörper-Klons zur eindeutigen Identifizierung des verwendeten Antikörper-Produkts (z.B. über https://www.cellsignal.com/learn-and-support/phosphositeplus-ptm-database oder vergleichbare Datenbanken)

• Darstellung der veränderten Raumstruktur des Proteins über UniProt

• Verweis auf eine vorangegangene Aktivität

MOD

Verknüpfungen zu anderen Ressourcen

Zeitliche Zuordnung im Verlauf

Inhalt

Mapping Datensatz zu FHIR

Suchparameter

Folgende Suchparameter sind für das Modul Onkologie relevant, auch in Kombination:

1. Der Suchparameter "_id" MUSS unterstützt werden:

   Beispiele:

   GET [base]/Observation?_id=12345

   Anwendungshinweise: Weitere Informationen zur Suche nach "_id" finden sich in der FHIR-Basisspezifikation - Abschnitt "Parameters for all resources".

Beispiele