<status value="active" /> <date value="2025-11-04" /> <publisher value="Robert Koch-Institut" /> <contact> <telecom> <system value="email" /> <value value="demis-support@rki.de" /> </telecom> </contact> <description value="Die Sequenz-Probe umfasst Angaben zum Sequenzierungsisolat, zum Sequenzierungsprotokoll, zur Sequenzierungsstrategie, zu den Reagenzien der Verarbeitung (Primer-Schemes, die zur Amplicon-Sequenzierung verwendet wurden und die Adapter), sowie das Datum des Probeneingangs und das Probenentnahmedatum. Die IGS-ID (DEMIS-Identifier für die Sequenz), die beim Sequenzupload vergeben wird, wird in der entsprechenden Extension im processing-Element angegeben." /> <jurisdiction> <coding> <system value="urn:iso:std:iso:3166" /> <version value="ALPHA-2" /> <code value="DE" /> </coding> </jurisdiction> <copyright value="Copyright (C) 2021-2025 Robert Koch-Institut" /> <fhirVersion value="4.0.1" /> <kind value="resource" /> <abstract value="true" /> <type value="Specimen" /> <baseDefinition value="https://demis.rki.de/fhir/StructureDefinition/Specimen" /> <derivation value="constraint" /> <differential> <element id="Specimen.meta"> <path value="Specimen.meta" /> <min value="1" /> <mustSupport value="true" /> </element> <element id="Specimen.meta.profile"> <path value="Specimen.meta.profile" /> <min value="1" /> <max value="1" /> <patternCanonical value="https://demis.rki.de/fhir/igs/StructureDefinition/SpecimenSequence" /> <mustSupport value="true" /> </element> <element id="Specimen.extension"> <path value="Specimen.extension" /> <slicing> <discriminator> <type value="value" /> <path value="url" /> </discriminator> <rules value="open" /> </slicing> <min value="0" /> </element> <element id="Specimen.extension:isolate"> <path value="Specimen.extension" /> <sliceName value="isolate" /> <short value="Zur Sequenzierung verwendetes Isolat (Laborinterne Nummer/Name/Identifier)" /> <definition value="Zur Sequenzierung verwendetes Isolat (Laborinterne Nummer/Name/Identifier)" /> <min value="0" /> <max value="1" /> <type> <code value="Extension" /> <profile value="https://demis.rki.de/fhir/igs/StructureDefinition/Isolate" /> </type> <mustSupport value="true" /> <isModifier value="false" /> </element> <element id="Specimen.subject"> <path value="Specimen.subject" /> <short value="Betroffene Person (anonym)" /> <definition value="Betroffene Person (anonym)" /> <type> <code value="Reference" /> <targetProfile value="https://demis.rki.de/fhir/StructureDefinition/NotifiedPersonAnonymous" /> <aggregation value="bundled" /> </type> </element> <element id="Specimen.processing"> <path value="Specimen.processing" /> <min value="1" /> </element> <element id="Specimen.processing.description"> <path value="Specimen.processing.description" /> <short value="Name des Sequenzierungsprotokolls" /> <definition value="Name des Sequenzierungsprotokolls" /> <mustSupport value="true" /> </element> <element id="Specimen.processing.procedure"> <path value="Specimen.processing.procedure" /> <short value="Sequenzierungsstrategie" /> <definition value="Sequenzierungsstrategie" /> <mustSupport value="true" /> <binding> <extension url="http://hl7.org/fhir/StructureDefinition/elementdefinition-bindingName"> <valueString value="SpecimenProcessingProcedure" /> </extension> <strength value="required" /> <description value="Sequenzierungsstrategie" /> <valueSet value="https://demis.rki.de/fhir/igs/ValueSet/sequencingStrategy" /> </binding> </element> <element id="Specimen.processing.additive"> <path value="Specimen.processing.additive" /> <slicing> <discriminator> <type value="value" /> <path value="resolve().code.coding" /> </discriminator> <rules value="closed" /> </slicing> </element> <element id="Specimen.processing.additive:adapterSubstance"> <path value="Specimen.processing.additive" /> <sliceName value="adapterSubstance" /> <short value="Adapter, die zur Library preparation verwendet wurden" /> <definition value="Adapter, die zur Library preparation verwendet wurden" /> <type> <code value="Reference" /> <targetProfile value="https://demis.rki.de/fhir/igs/StructureDefinition/AdapterSubstance" /> <aggregation value="bundled" /> </type> <mustSupport value="true" /> </element> <element id="Specimen.processing.additive:primerSubstance"> <path value="Specimen.processing.additive" /> <sliceName value="primerSubstance" /> <short value="Primer-Schemes, die zur Amplicon-Sequenzierung verwendet wurden" /> <definition value="Primer-Schemes, die zur Amplicon-Sequenzierung verwendet wurden" /> <type> <code value="Reference" /> <targetProfile value="https://demis.rki.de/fhir/igs/StructureDefinition/PrimerSubstance" /> <aggregation value="bundled" /> </type> <mustSupport value="true" /> </element> <element id="Specimen.processing.time[x]"> <path value="Specimen.processing.time[x]" /> <short value="Verarbeitungsdatum z.B. 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