Beispiel 2 - Nachweis von Pseudomonas aeruginosa in der aeroben Blutkultur mit Nicht-Empfindlichkeit gegen Penicilline, Cephalosporine und Carbapeneme

In diesem Beispiel abgebildete Verfahren sind

• Bakterielle Kultur
• Multiplex-PCR
• Agardiffusion zur phänotypische Resistenztestung (qualitative Ergebnisse)

Wie im ersten Beispiel ist das Ergebnis der kulturellen Anreicherung in der anaeroben Blutkulturflasche negativ.

In der aeroben Blutkulturflasche ist Wachstum nachweisbar. Entscheidend für die Ergebnisse der aeroben Blutkulturfalsche ist in diesem Beispiel die Übermittlung des Ergebnisses der Multiplex-PCR.

Entsprechend der Regeln um Umgang mit der Semantik für molekulare Verfahren werden in dieser Pilotphase die einzelnen Analyten der Multiplex-PCR in der Achse "component" in einzelnen "Observations" abgebildet. Das unten abgebildete Beispiel enthält eine Auswahl an Analyten aus einem Panel für Multiplex-PCRs aus Blutkulturen.

Für die phänotypische Resistenztestung mittels Agardiffusion werden in diesem Beispiel die quantitativen Ergebnisse einschließlich der Einheit kodiert nach UCUM mit Interpretation des Ergebnisses nach EUCAST angegeben.

• Die Übermittlung der quantitativen Ergebnisse wird für ARS angestrebt und sollte, so möglich, bevorzugt übermittelt werden.
• Die Angabe der Norm, nach der die Ergebnisse der phänotypischen Resistenztestung bewertet werden, wird in "Observation.referenceRange.extension:norm" angegeben.
• Für Gentamicin gibt EUCAST keinen Breakpoint an, so das in diesem Beispiel das quantitative Ergebnis unter Observation.valueCodeableConcept angegeben wird, sowie "EUCAST" als die angewandte Norm unter "Observation.referenceRange.extension:norm". Unter "Observation.interpretation" wurde der SNOMED-Code "82334004 Indeterminate (qualifier value)" verwendet. Alternativ kann eine Interpretation des quantitativen Ergebnisses angegeben werden und als angewendete Norm zur Bewertung des Ergebnisses "other" unter "Observation.referenceRange.extension:norm".